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Project description:

When a tumor cell dies, its contents are dispersed into the bloodstream and can serve as a biomarker for cancer. Liquid biopsies thus offer a new alternative for cancer diagnosis by detecting cancer markers in the blood. In this context, our lab is developing cutting-edge molecular and computational methods to improve on the sensitivity and specificity of circulating tumor DNA (ctDNA). Our team has access to the CRCHUM’s institutional biobanks and thus has opportunities to create ctDNA assays for many different cancer types, including ovarian, head & neck, lung, skin and bladder cancer. This research project will enable graduate students to develop an expertise in next generation sequencing, bioinformatics, machine learning, oncology and genomics.

Pre-requisites:

We are looking for students who are passionate about biomedical research and being part of the state-of-the-art. Therefore, we are looking for candidates with:

• Scientific curiosity, strong motivation, initiative and team work
• Training in molecular biology or programming (python, R, C++)

Note:

We are looking for motivated students to join our lab as graduate students (M.Sc., Ph.D.) for thesis work.

Description générale du projet :

Lorsqu’une cellule tumorale meurt, son contenu est versé dans la circulation et peut servir en tant que biomarqueur pour le cancer. Les biopsies liquides ouvrent donc une nouvelle ère dans le diagnostic du cancer, en rendant possible la détection de tumeurs à partir d’un simple prélèvement sanguin. Dans ce contexte, notre laboratoire développe des technologies moléculaires et informatiques pour améliorer la sensibilité et la spécificité de la détection de l’ADN tumoral (ctDNA). Via les biobanques institutionnelles du CRCHUM, notre équipe a accès à une large cohorte de patients atteints de divers cancers (ovaire, tête et cou, vessie, poumon, mélanome). Ainsi, ce projet de recherche permettra à l’étudiant.e sélectioné.e de développer une expertise en next generation sequencing, bioinformatique, apprentissage machine, oncologie et en génomique.

Exigences et pré-requis :

Nous recherchons des étudiant.es passioné.es par la recherche biomédicale et les technologies de pointe. Les compétences désiré.es des candidat.es sont :

• Curiosité scientifique, motivation, initiative et esprit d’équipe
• Formation en biologie moléculaire ou en programmation (python, R, C++)

Note:

Cette position est offerte aux étudiant.es qui souhaitent obtenir leur maitrise ou leur doctorat dans notre laboratoire.

 Le Département de biochimie et médecine moléculaire de l’Université de Montréal, en collaboration avec le Hub Canadien de Bio-informatique, cherche à recruter un(e) agent(e) de coordination en bio-informatique dynamique et motivé(e). Rejoignez une équipe reconnue pour son excellence dans la formation en bio-informatique, et contribuez à son expansion en prenant part à la coordination régionale des initiatives de formation. Travailler dans notre unité, c’est participer à des projets innovants pour façonner l’avenir de la bio-informatique dans la province, en bénéficiant d’un environnement stimulant et d’une culture fortement axée sur l’innovation.

Les raisons pour lesquelles cet emploi est fait pour vous

• Vous avez une passion pour la formation scientifique de pointe.
• Vous maîtrisez la gestion des opérations administratives nécessaires à la coordination et au déploiement des activités de formation à travers le Québec.
• Votre aimez travailler en équipe et tisser des liens avec des experts reconnus dans le domaine de la bio-informatique et de la biologie computationnelle.
• Vous êtes déterminé à mettre vos compétences au service de l’expansion de notre capacité de formation et à stimuler l’engagement communautaire à travers le Québec.

Dr. Pingzhao Hu in the Department of Biochemistry and the Department of Computer Science at the Western University has a fully funded PhD student position in AI-guided drug discovery (phulab.org/positions). The successful candidate can register in Collaborative Specialization in Machine Learning in Health and Biomedical Sciences (uwo.ca/sci/datascience/graduate/collaborative-specialization-ml-health-biomedical.html) through the Department of Biochemistry.

Dr. Hu holds the position of Tier 2 Canada Research Chair in Computational Approaches to Health Research. With extensive experience in mentoring trainees at various levels, many of Dr. Hu’s mentees have received international and national awards, secured positions in high-tech companies such as Google, Microsoft, and Amazon, and reached the significant milestone of tenure-track assistant professor positions in Canada.

Ancient Sedimentary DNA Graduate Student

The Golding and Poinar labs are looking for a Master’s Student (MSc) to work on sedimentary DNA from ancient permafrost in the attempt to reconstruct past ecosystems to help better contextualize the causes and consequences of late Pleistocene extinctions as well as microbial ecology during major climate upheaval.