Postdoctoral Fellow in Computational Biology (ASCEND Program)

About Epitopea

Epitopea is a biotech company developing next-generation cancer immunotherapies. Using our Cryptigen™ platform, we combine immunopeptidomics and transcriptomics to identify shared tumor-specific antigens. By integrating multi-omic datasets with advanced computational methods, we aim to create accessible, off-the-shelf cancer vaccines for patients.

The Opportunity

We are seeking a Postdoctoral Fellow in Computational Biology to join Epitopea’s ASCEND Fellowship program. This is a unique opportunity to contribute to translational research at the interface of immunology, cancer biology, and computational science, while receiving tailored career development support from adMare BioInnovations.

The Fellow will work closely with Epitopea’s multidisciplinary team of wet-lab scientists and computational biologists. This is a rare opportunity to join a growing biotech company at a formative stage and to make a direct impact on early vaccine development.

French version:

À propos d’Epitopea

Epitopea est une entreprise de biotechnologie qui développe des immunothérapies de nouvelle génération contre le cancer. À l’aide de notre plateforme Cryptigen™, nous combinons l’immunopeptidomique et la transcriptomique pour identifier des antigènes communs spécifiques aux tumeurs. En intégrant des ensembles de données multi-omiques à des méthodes computationnelles avancées, nous visons à créer des vaccins contre le cancer accessibles et “off-the-shelf”, pouvant bénéficier à un grand nombre de patients.

L’opportunité

Nous recherchons un chercheur postdoctoral en biologie computationnelle pour rejoindre le programme de bourses ASCEND d’Epitopea. Il s’agit d’une occasion unique de contribuer à la recherche translationnelle à l’interface de l’immunologie, de la biologie du cancer et des sciences computationnelles, tout en bénéficiant d’un soutien personnalisé en matière de développement de carrière de la part d’adMare BioInnovations.

Le boursier travaillera en étroite collaboration avec l’équipe multidisciplinaire d’Epitopea, composée de scientifiques de laboratoire et de biologistes computationnels. Il s’agit d’une occasion rare de rejoindre une entreprise de biotechnologie en pleine croissance à un stade formatif et d’avoir un impact direct sur le développement de nos vaccins.

• Develop and apply computational approaches for integrating multi-omic datasets (transcriptomics (bulk or single-cell), proteomics, …) to prioritize therapeutic targets.
• Collaborate with immunologists and molecular biologists to design meaningful experiments and computational analyses, and interpret results in a translational context.
• Build scalable, reproducible bioinformatics workflows to support ongoing and future R&D initiatives.
• Contribute to the dissemination of results through presentations, reports, and potentially publications, depending on project confidentiality.
• Stay current with advances in computational biology, immuno-oncology, and data science, and proactively bring innovative ideas to the team.

French version:

• Développer et appliquer des approches informatiques pour intégrer des ensembles de données multi-omiques (transcriptomique (en vrac ou unicellulaire), protéomique, etc.) afin de hiérarchiser les cibles thérapeutiques.
• Collaborer avec des immunologistes et des biologistes moléculaires pour concevoir des expériences et des analyses computationnelles pertinentes, et interpréter les résultats dans un contexte translationnel.
• Mettre en place des pipelines bioinformatiques évolutifs et reproductibles pour soutenir les initiatives de R&D en cours et futures.
• Contribuer à la diffusion des résultats par le biais de présentations, de rapports et, le cas échéant, de publications, en fonction de la confidentialité du projet.
• Se tenir au courant des avancées en biologie computationnelle, en immuno-oncologie et sciences des données, et apporter de manière proactive des idées innovantes à l’équipe.

• PhD (completed or near completion) in bioinformatics, computational biology, or a related field.
• Hands-on experience with one or more of the following:
  • Transcriptomics (bulk or single-cell RNA-seq)
  • Proteomics
  • Cancer genomics / tumor evolution
  • Multi-omics data integration
  • Machine Learning
• Proficiency in Python and/or R for data science and bioinformatics.
• Familiarity with reproducible research practices (e.g., Git, workflow management systems).
• Strong communication skills, with the ability to work collaboratively in a multidisciplinary team.
• Curiosity, adaptability, and an enthusiasm for contributing to translational science in an industry setting.

French version:

• Doctorat (obtenu ou en cours d’obtention) en bio-informatique, biologie computationnelle ou dans un domaine connexe.
• Expérience pratique dans un ou plusieurs des domaines suivants :
  • Transcriptomique (séquençage d’ARN en vrac ou unicellulaire)
  • Protéomique
  • Génomique du cancer / évolution tumorale
  • Intégration de données multi-omiques
  • Apprentissage automatique
• Maîtrise de Python et/ou R pour la science des données et la bio-informatique.
• Connaissance des pratiques de recherche reproductibles (par exemple, Git, systèmes de gestion des flux de travail).
• Solides compétences en communication, avec la capacité de travailler en collaboration au sein d’une équipe multidisciplinaire.
• Curiosité, adaptabilité et enthousiasme pour contribuer à la science translationnelle dans un contexte industriel.