Un(e) ingénieur(e) en bio-informatique

Institution/Company:
Paris Brain Institute
Location:
PARIS, Ile-de-France, France
Job Type:
  • MSc (18 months with the possibility for conversion to permanent)
Degree Level Required:
Masters, Bachelor's
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Un(e) ingénieur(e) en bio-informatique

Votre travail consistera à :

● Assurer l’analyse bio-informatique des données issues des technologies NGS

● Développer et mettre en place des nouveaux pipelines pour l’analyse bio-informatique

● Assurer une veille scientifique et technique (rechercher des nouvelles méthodes/logiciels pur l’analyse du séquençage à haut débit).

● Fournir une expertise et des conseils méthodologiques aux équipes de recherche ;

● Accompagner les équipes et les projets de recherche dans la mise en place des plans d’analyse et le traitement des données biologiques et médicales ;

● Participer à des missions de formation en bio-informatique destinés aux biologistes, cliniciens et médecins.

Vous participerez à l’analyse et à l’interprétation des données omiques neuro focalisées.

Responsibilities:

● Assurer l’analyse bio-informatique des données issues des technologies NGS

● Développer et mettre en place des nouveaux pipelines pour l’analyse bio-informatique

● Assurer une veille scientifique et technique (rechercher des nouvelles méthodes/logiciels pur l’analyse du séquençage à haut débit).

● Fournir une expertise et des conseils méthodologiques aux équipes de recherche ;

● Accompagner les équipes et les projets de recherche dans la mise en place des plans d’analyse et le traitement des données biologiques et médicales ;

● Participer à des missions de formation en bio-informatique destinés aux biologistes, cliniciens et médecins.

Qualifications:

Savoir :

● Expérience professionnelle souhaitée d’au moins un an dans le domaine souhaité

● Diplômes : Bac+5 (master ou ingénieur) en bio-informatique, ou niveau équivalent en biologie/informatique complété par une expérience professionnelle dans l’autre domaine

Savoir Faire :

● Expertise en analyse de données génomiques

● Maîtrise des environnements UNIX (shell)

● Maîtrise de la programmation (notamment des langages de script et R)

● Bonnes connaissances des outils standards de bio-informatique pour l’analyse et l’interprétation des données de séquençage haut-débit (DNA, RNAseq, Single-Cell RNAseq)

● Pratique experte d’au moins une méthode d’analyse des données NGS

● Autonomie pour apprendre rapidement des nouvelles méthodes adaptées à la grande variété des données

● Des compétences dans les domaines suivants serait un plus: versionnage du code avec GIT, utilisation de cluster de calcul (SLURM), utilisation de gestionnaire de workflow type Snakemake

Savoir-être :

● Bonne maîtrise de l’anglais scientifique ;

● Capacité d’intégration au sein d’une équipe multidisciplinaire;

● Capacité de communication avec des chercheurs venant d’horizons scientifiques variés ;

● Motivation pour les projets complexes et pour faire avancer la recherche en Neurosciences !

  • How to Apply

    Please include a CV and Cover letter